１９６４年，東京奧林匹克的前夕，日本開始有了改變。
高中生間黑男在童年時期的一件意外至今又併發了後遺症；
另一方面，
棒球校隊王牌投手矢島也遭人懷恨而被殺成重傷。
從此都要與輪椅相伴的這兩個年輕人遇見了一名推廣輪椅籃球運動的醫生…
在社會結構進行著變革的時代，
年少的黑傑克以行醫為目標的成長歷程在此呈現!!
作者簡介：
原作／手塚治虫（1928年11月3日～1989年2月9日）
日本漫畫家、動畫師、動畫監製，同時也是一位醫學博士。筆下的《原子小金剛》、《森林大帝》、《怪醫黑傑克》、《三眼神童》、《佛陀》等等均是大眾耳熟能詳的不朽名作，對日本漫畫及動畫界影響深遠，生前即被譽為「漫畫之神」。
腳本／田由秋
日本漫畫腳本家，也是手塚作品的忠實粉絲。曾操刀過許多強調社會現實面的作品（例如『惡滅』），風格犀利。
漫畫／大熊由護
畫風美型，更同時具備令人移不開視線的魄力，在黑傑克的世界吹起一股新的旋風。