明清檔案，原為清代內閣大庫所藏。清內閣為國家庶政所出之地，亦為制誥典冊之府，所存檔案都是當日構成史蹟者自身的敘述。又清初纂修明史及三朝實錄，蒐集啟禎兩代的案卷，以及瀋陽陪都的舊檔。
民國元年，檔案被裝為八千藏袋；民國八年，教育部做了第一次的整理，整理的結果分為「保存」與「放棄」兩部分，「保存」的資料後北京大學分的一部份，其餘的藏於歷史博物館；至於「放棄」的，則散落棄置了。歷史博物館後出賣了這批檔案，輾轉由天津李盛鐸購得。史語所於民國十七年設立，所長傅夢真就任隨即收買天津李氏所藏大庫檔案，並擬定整理與出版計畫。然因戰亂頻仍，至民國三十六年時，將關於清代開國史料以及明季重要文件，選出分類影印，稱為「明清檔案圖版」，即今「明清檔案存真選輯」，並擬定每年印出一部以廣其傳。
「明清檔案存真選輯」一書之印行，無非希圖將每一文件的原貌公之於世，期於學術研究必增加甚多樂趣，即如有若干文件已見於《明清史料》，然因影印文件可以引人入勝，且保留明清兩代的公文呈式，對於學術研究實為一件極富意義的貢獻。
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