《臺灣文學論叢》創刊於2009年，每年發行一輯，為清華大學臺灣文學研究所歷屆博碩士論文優秀篇章經審查、修改後之集結。從原住民文學、古典文學、日治時期文學到當代文學，包含臺灣文學之本體研究、跨文化流動研究及區域比較研究。本論叢除展現本所學生研究興趣及成果以就教於學術先進之外，也期待與其他人文社會領域之青年研究者切磋與對話。
臺灣文學研究所創立於2002年8月，除了招收本地博、碩士生，接受陸生、僑生、港澳生及海外生就讀之外，自2006年起跟人社院語言所、人類所共同創設「臺灣研究教師在職進修碩士學位班」，2010年增設人社院學士班「文學與創作」學程，為國內唯一兼重研究、創作與教師進修三大面向之臺灣文學系所。2009年起結集優秀畢業論文發行《臺灣文學論叢》年刊，2012年發起國內第一個「臺灣文學研究會」。此外，每年定期與國內其他大學舉辦研究生學術會議，亦組織多屆師生海外學術訪問團出訪各國。
