《明清臺灣檔案彙編》系列共八冊，收錄自明嘉靖26年（1547）至清康熙22年（1683）清帝國領有臺灣以前，有關臺灣本島及鄰近海域的公文史料。
《明清臺灣檔案彙編》資料來源以已刊文獻為主，蒐集範圍及於各種明清檔案彙編、方志、碑刻以及文集等，其他如書信、議論以及具社會規範作用之公文，原則上不在收錄之列。
檔案文件之編排按時間順序，由前而後依序排比。每件都盡量註記確切年月日，以便徵引查核。若年月日無法確認者，則以有限的線索將文件編排於同朝、同年、同月之末。
作者簡介
李文良，國立臺灣大學歷史學博士，明清臺灣檔案彙編委員會負責人。曾任職於中央研究院社會學研究所、日本東京大學大學院、東吳大學等地，目前任職於國立臺灣大學歷史學系。