在阿金鍥而不捨的追逐下，戴面具男子的目的以及隱藏在面具下的真面目一一顯露出來，他的目的就是『捕捉時間』！！而傳說中的神奇寶貝與神奇寶貝圖鑑的持有人陸聚集在桐樹林，準備展開一場激烈的攻防戰！！就在劇情超乎想像的第三章即將邁入最高潮的時候，阿金他卻…！？
