退伍軍人菌廣泛存在於自然界水體和土壤中，而人造水環境容易因結構複雜的管線設計，導致停滯不動或水流緩慢的水體，再配合日照、溫度、pH值、間歇性使用及淤塞情形，致使容器內形成生物膜（biofilm），生物膜更是微生物生長與繁殖之要素，在這些有機、無機物及水溫等因子作用下，無形中提供了退伍軍人菌一個良好的移生環境。國外爆發退伍軍人病流行事件不勝枚舉，但由於目前尚無人傳人的案例報導，因此在退伍軍人病的防治上，應注意人工水體環境管路之設計、平時操作及保養方面等管理措施，並應定時施以清潔及消毒工作。常用來控制退伍軍人菌的消毒措施包括：加熱法、加氯法、銅銀離子消毒法、臭氧與紫外線等方式。藉由這些可抑制水中退伍軍人菌繁殖所需之方式，降低其於環境中檢出之陽性率，以減少吸入後致病之風險，便成為目前最主要的防治概念。
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