巴特為了救出被陷害的曾我上校,與石川、波瑪等人展開營救行動,並和草薙素子展開對決。但是當年在「庫桑共和國」發生的那件事,其實背後還隱藏著不為人知的真相……!本案一切的事實真相將會在本集揭曉,「攻殼機動隊」也即將成立!