表面看似和平的日本，其實是各國諜報單位覬覦的目標，然而，卻有一族默默收集各國情資並默默守護日本800年──「阿賀」。阿賀邦彥及阿賀瑪利亞則是這族的末裔，邦彥曾多次提供情報給政府要他們多家注意，但卻遭多次忽略，因而變得不信任政府，不再為政府工作。於是，內閣主席參謀‧九鬼友馬登門拜訪並邀請他再度投身諜報單位為府工作。在與九鬼友馬的談話過程中，畢竟身上流著800年來「阿賀」一族的血液，那種驕傲不容他拒絕、也不想把其交付給別人，所以邦彥便答應再次重操舊業並培養繼任之人。
數年前，阿賀邦彥與妻子‧咲查到日本政府的電報已遭某國竊取、解讀。九鬼內閣主席參謀得知此事後，決定讓天才‧江波透流祕密著手開發絕對不可能解讀的「量子暗號」。事隔數年，就在暗號技術將完成之際，江波透流的身邊開始出現可疑分子。為了保護江波透流，於是邦彥開始展開行動！
數年前，阿賀邦彥與妻子‧咲查到日本政府的電報已遭某國竊取、解讀。九鬼內閣主席參謀得知此事後，決定讓天才‧江波透流祕密著手開發絕對不可能解讀的「量子暗號」。事隔數年，就在暗號技術將完成之際，江波透流的身邊開始出現可疑分子。為了保護江波透流，於是邦彥開始展開行動！