歌琉多一行人戰勝了安娜塔西雅所率領、驅使舊世代魔法的最強集團『排解難題』後，重建海上水晶魔法學園葛摩諾亞，拾回喪失的昔日學校生活。眾人將於『先出事變』中所失去的種種謹記在心，並持續進行訓練，以對抗即將出現的下一波『威脅』。
「呼，咿，妳、妳為什麼連大氣都不喘一下啊……？」
「那我流一點汗會比較好嗎？我擦、我擦。」
然而，卻有人潛入校內，企圖將這份和平摧毀得支離破碎――役使阿努比斯的少女為『排解難題』其中一員‧安娜塔西雅的……親生妹妹！？
「呼，咿，妳、妳為什麼連大氣都不喘一下啊……？」
「那我流一點汗會比較好嗎？我擦、我擦。」
然而，卻有人潛入校內，企圖將這份和平摧毀得支離破碎――役使阿努比斯的少女為『排解難題』其中一員‧安娜塔西雅的……親生妹妹！？