農業試驗所創立於1895年,以試種日本稻開啟臺灣農業科研體系,並落腳於臺北市的蟾蜍山下。臺灣光復後,經數次改組異動後,轄2分所,復因都市發展需求及城市化產生的影響,在行政院的支持下於1977年搬遷至現址,接續農業科學研究,提供政府推動政策之重要科學依據與支持。2023年8月1日農業部成立,本所同步改組,亦新成立花卉試驗分所。將透過創新及加值、加強與產學研界的跨域合作,持續以農業科技支持臺灣農業。