「全國高中生魔法學論文競賽」在橫濱舉行。
神祕的武裝集團忽然入侵魔法科高中學生們的這個風光舞臺。
他們的真實身分，是來自「大陸」的大亞聯軍魔法師暨機動兵器群。
武裝軍隊為達到目的不惜殺害市民，
在如此大規模的混亂局勢中，
司波達也和學生會成員們共同摸索逃出困境的方法。
同一時間，最新銳魔法技術武裝集團——
國防陸軍一○一旅獨立魔裝大隊出現在競賽會場。
劣等生達也無視於驚訝的七草真由美與十文字克人，
「受命」前往戰場的最前線。
在疑惑的魔法科學生們注視之下和深雪完成「儀式」的達也，終於解放恐怖的「禁忌之力」。