整本《圓覺經》，都是回答十一位菩薩之所問，所答甚為深密，若不知其密意，便會認為本經與其他經典所說不同，由是疑為偽經。
《圓覺經》中實在已有了義大中觀的基、道、果密意。基是見地，說為樂空不二；道是觀修之所依，說為大圓滿或大手印；果是究竟觀修之所證，說為如來藏，或說為不二法門， 深般若波羅蜜多等。本經之所說，包括此三者。
《圓覺經》在漢傳佛教中是一本很重要的經典，首先推廣這本經的人，就是身兼禪宗與華嚴宗祖師的圭峯宗密， 由他在兩宗推廣，兼且將華嚴教義引入禪宗，又將禪宗心性引入華嚴，因此便影響到研究心性與佛性的天台宗，隨即又對淨土宗發生影響，所以這本經的地位，在漢土便高如須彌山。 可是在日本鎌倉時代（十三世紀），曹洞宗的始創人道元禪師（1200-1253）卻對本經及《楞嚴經》質疑，認為是偽經，甚至說有外道思想。他的說法在日本並不受到重視，近代有些學者將道元的質疑再行提出，於是始引發了《楞嚴》與《圓覺》真偽的研究。
持平之說，應如智昇那樣，由經的內容來判別真偽，而不是由具體的翻譯年代紀錄來判別。譯人的可疑可以研究，但亦不能單憑他沒有生平紀錄，便否定他的存在。在流傳的佛經中，往往有些「缺譯」的經典，連譯人的名字都失缺，然則難道這些統統都是偽經。關本經真偽問題，本書導論中提出一些說法。
