大正二二年（２０５４年），正一等一群孩子們搭乘由長崎出港的調查船。這艘船遭到鎧甲武士組成的水軍的襲擊，成了人質。此時出現一艘名叫“品川連合”的特務咆哮艦擊退了鎧甲武士水軍，收容了正一他們。同船的未來人說「日本因為時間戰爭而被瓜分。我們要拯救未來，奪回過去!」於是，正一他們被捲入群雄割據的時代漩渦裡
