碇真嗣獲得了「ＥＶＡ」，並且下定決心要與使徒戰鬥。
可是看到渚薰與綾波零的相處之後，真嗣對自己的存在感到疑問。
事到如今即使多了自己，是不是也只是變成累贅而已——
就在此時，薰來到了真嗣他家。
——即將揭曉的ＥＶＡ的秘密…
新感覺「學園福音戰士」第二集！
可是看到渚薰與綾波零的相處之後，真嗣對自己的存在感到疑問。
事到如今即使多了自己，是不是也只是變成累贅而已——
就在此時，薰來到了真嗣他家。
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