一九九O至二OOO年，經過十載歲月的淘洗、沈澱、記錄、書寫，楊樹清交出了兩冊、二十篇、四十萬字報導文學作品，配合大量珍貴的歷史、現場圖片，分別取名《金門田野檔案》、《金門島嶼邊緣》，列入《金門學》叢刊。
《金門田野檔案》：（１）〈仙洲行腳〉。（２）〈發現紫陽夫子〉（３）〈尋找蘇王爺〉。（４）〈酒鄉之歌〉。（５）〈邊緣發聲〉（６）〈慈湖驚夢〉（７）〈小三通，19952〉。（８）〈等待三通的土地〉（９）〈哭砂〉。（10）〈螢火燎原〉。
《金門島嶼邊緣》：（１）〈被遺忘的兩岸邊緣人〉。（２）〈消逝的漁民國特〉。（３）〈匪來匪去〉。（４）〈戰爭的告別式〉。（５）〈白色歲月〉（６）〈誰殺了李金珍？〉。（７）〈消失的古坵村〉。（８）〈流彈淚〉。（９）〈翟山事件〉。（10）〈哭喊解嚴〉。
文史學者、文化評論家龔鵬程博士評析：「楊樹清的筆下從來不缺少關懷弱勢、深入基層、批判社會、提倡人道精神等質素，但支撐這一切，令人讀之興感，驟然而生關切金門之念者，卻非這些，而是敘述者的聲腔，也就是報導時的文采。因此，他寫金門，不只是做為史料史錄，也不只是調查報告。雖然在目前，為金門一地花那麼大氣力、費那麼多筆墨的，天下只有他一人，但其報導，仍有超越一時一地之價值。未來報導文學之發展，也應該會要重視他這個例子。」