《般若藏》在編纂之初及不計繁瑣，一一比對各版藏經之優劣，採取最精優之版本為底本，並參考各版藏經如《高麗藏》、《嘉興藏》、《清藏》等及各類辭書，近代著述數十餘種，嚴加挍勘。內容收錄有般若及三論宗典籍之精華，依次分為「經部」、「宗論部」、「著述部」。
冊數 經名
01大般若經一
02大般若經二
03大般若經三
04大般若經四
05大般若經五
06大般若經六
07大般若經七
08大般若經八
09大般若經九
10大般若經十
11大般若經十一
12大般若經十二
13大般若經十三
14大般若經十四
15大般若經十五
16大般若經十六
17大般若經十七
18大般若經十八
19大般若經十九
20大般若經二十
21大般若經二十一
22大般若經二十二
23金剛經外五部
24大智度論一
25大智度論二
26大智度論三
27大智度論四
28大智度論五
29金剛般若論外四部
30仁王經疏外一部
31中論外六部
32迴諍論外三部
33中論疏
34般若燈論釋外二部
35肇論外三部
36三論玄義外二部
37中觀今論外三部
38般若心經講要外六部
39十二門論講錄外二部
40中觀論頌講記
41附錄
42總索引