本書將非營利組織租稅分為六部份。
第一部份為基本觀念篇，探討非營利組織之概論、分類、興起及現況。
第二部份為租稅架構篇，探討租稅之基本概念、租稅法之觀念與結構及非營利組織之租稅優惠。
第三部份為所得稅規範篇，探討非營利組織銷售貨物或勞務以外所得之租稅優惠、免稅標準有關支出占收入比例計算及課稅所得計算之議題。
第四部份為所得稅實務篇，探討非營利組織所得稅申報與扣繳實務，並說明機關團體所得稅規範之爭議與建議。
第五部份為營業稅篇，探討非營利組織營業稅徵免之規範、申報實務及營業行為之判斷。
第六部份為租稅法規附錄篇，列示本書所涉及之法律命令與解釋函令之索引及內容。