為了讓最強的等級5超能力者一方通行提升能力,在學園都市將兩萬名美琴的複製人「妹妹們」全數殺死的「絕對能力進化計畫」。美琴為了阻止這相實驗,而打算向一方通行挑戰。但就在這時,上条當麻卻出現了……最強與最弱的男人激戰開始!