光太郎告別了從塞爾達脫逃出來的冷凍睡眠者們後，獨自一人回到了聖地。然而因為某位上級人物秘密的進行了一項陰謀，導致聖地變成了非安全地帶…但此時的光太郎卻還渾然不知自己早已身陷危機中…！而另一方面，利克與威爾王子在相繼得知光太郎有了危險之後，便火速前往聖地…
