「防疫檢體採檢手冊」係依傳染病防治法第46條規定編列，確保防疫檢體的採檢及送驗品質，並維持後續檢驗的正確性。本手冊共分十一個章節，第一章為通則，含傳染病病人檢體定義、採檢者，採檢容器及檢體處理通則，第二章防疫檢體採檢及運送規定，第三章傳染病病人檢體採檢步驟，第四章防疫檢體包裝及運送標準作業程序，第五章防疫檢體運送箱外溢及滲漏之除污標準程序，第六章節防疫檢體運送箱消毒，第七章防疫檢體送驗地點及檢驗天數，第八章疾病管制局研究檢驗中心實驗室聯絡電話，第九章疾病管制局昆陽辦公室地理位置，第十章國際港埠發燒篩檢作業流程，最後第十一章節疑似傳染病死亡個案解剖。
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