一、曾文水庫 1.1單項水質分析 101年1~12月曾文水庫超過水質標準之項目有pH，懸浮固體，溶氧，生化需養量，總磷，大腸桿菌群，錳等7項。 曾文水庫區內pH值過高，應屬夏季藻類行光合作用消耗氫離子有關；懸浮固體物不合格點位主要集中於底層測點，主因為採樣時擾動底泥導致數值異常偏高，其中重金屬錳升高原因主要吸附在底泥微粒之錳，因底泥揚起造成水質中錳濃度之升高(水質中重金屬是以總量管制)。 生化需氧量方面，101年1~12月曾文水庫區內(湖泊)並無生化需氧量過高之現象，唯在庫區外出水口與集水區射免潭吊橋、沙崙橋有短暫不合格月份，應屬偶發性現象。 溶氧方面，101年1~12月發生溶氧不符之地點，主要在監測點底層之處，一般湖泊底層溶氧相對較低，此現象應屬合理。 曾文水庫集水區由以往監測的數據發現，每年六~十月的豐水期，暴雨後的沖刷以致於懸浮固體偏高造成，相對造成水質中錳濃度之升高。除此之外沖刷物中挾帶的營養鹽，使得總磷濃度上升。 1.2水體品質指標庫區內(湖泊)WQI(定義詳見2.2)： 表層為75~93間屬良好至特優，大多 屬特優等級。(良好26/60、特優34/60) 底層為61~92間屬中等至特優，大多屬良好等級。(中等6/60、良好40/60、特優14/60) 庫區外(河川)WQI：67~91間屬中等至特優，大多屬特優等級。(中等2/60、良好20/60、特優38/60) 由WQI指標可知，曾文水庫區內表層水質介於良好至特優等級，底層水質因易受底泥干擾而產生明顯變化，但從WQI值可看出目前監測點底層之水質屬性良好。 1.3河川污染指標RPI(定義詳見2.2)：1.0~3.25屬未受污染至中度污染等級，大多屬未受污染等級。(中度污染5/60、輕度污染5/60、未受污染50/60) RPI主要的污染因子為懸浮固體物，其主要來自豐水期雨季致水中懸浮固體物偏高，使RPI昇高。 1.4優養指標CTSI(定義詳見2.2)：31.5~55間，間貧養至優養等級，多屬普養等級。(優養11/60、普養42/60、貧養7/60) 1.5藻類分析：表層藻類計數860~19,920間，以藍綠藻為優勢種其次為綠藻，有過優養化現象與趨勢。 1.6藻毒分析：所有測值皆符合WHO安全限值1.0 ug/L。 1.7臭味分析：2-MIB與Geosmin測值符合日本標準10 ng/L。 1.8農藥分析：所有測值低於偵測極限。 1.9魚類調查：3目7科17種 主要魚種有鱸鰻、平頜魚鱲、粗首鱲、台灣馬口魚、台灣石(魚賓)、台灣鏟頷魚、泥鰍。從生物多樣性分析結果，曾文水庫之優勢種不明顯，魚類物種分布尚屬平均。從豐富度指數值可看出曾文水庫生物魚類種類多。 二、牡丹水庫 2.1單項水質分析 101年1~12月牡丹水庫超過水質標準之項目有pH、懸浮固體、溶氧、生化需氧量、錳、大腸桿菌等6項。 懸浮固體、溶氧、錳濃度偏高與曾文水庫成因相似，都發生在監測點底層與水位較低有關。在101年度1~12月的調查中，牡丹水庫上游處於1，7，8月發生生化需氧量超標之現象，可能短時有機物排入水庫中引起之突發現象。總體而言牡丹水庫水質良好。 2.2水體品質指標WQI：表層為82~92間屬良好至特優，大多屬特優等級。(良好4/36、特優32/36) 底層為62~93間屬中等至特優，多屬特優等級。(中等1/12、良好5/12、特優6/12) 庫區內表層水質大多屬特優等級，底層水質雖因水位低受干擾而產生明顯變化。但從WQI值可看出目前監測點底層之水質屬性良好。 2.3優養指標CTSI：41.7~57.3間，大多屬普養等級。(優養12/36、普養24/36) 2.4藻類分析：表層藻類計數800~15,100間，以矽藻為優勢種其次為綠藻，營養狀態屬優養與中優養。 2.5藻毒分析：所有測值皆符合WHO安全限值1.0 ug/L。 2.6臭味分析：2-MIB與Geosmin測值符合日本標準10 ng/L。 2.7農藥分析：所有測值低於偵測極限。 2.8魚類調查： 主要魚種有吳郭魚、鯁魚、苦槽仔、鲶魚、翹嘴紅鮊及紅鰭鮊。生物多樣性分析結果與曾文水庫相似，優勢種不明顯，魚類物種分布尚屬平均。從豐富度指數值可看出牡丹水庫生物魚類種類多。 三、阿公店水庫 3.1單項水質分析 101年1~12月阿公店超過水質標準之項目有懸浮固體、生化需氧量、錳、總磷與大腸桿菌群等5項。 阿公店水庫自6月1日起至9月10日止為阿公店水庫空庫防淤期。因水位過低易導致水體不穩定，以致懸浮固體物、生化需氧量、總磷、錳與大腸桿菌濃度偏高。 3.2水體品質指標WQI：為48~91間屬中下至特優，多屬特優等級。(中下1/48、中等14/48、良好15/48、特優18/48) 3.3河川污染指標RPI：監測點月眉堰為1.0~3.25屬未受污染至中度污染等級，多屬未受污染等級。(中度污染5/12、未受污染7/12) RPI變差之主要影響因子為懸浮固體物。因水位過低以致於懸浮固體濃度超過100 mg/L所致(單項污染積分10分)。 3.4優養指標CTSI：44.6~78.2間，大多屬優養等級。(優養28/36、普養8/36) 主要因集水區靠近開發區域，氮磷等營養鹽較多所致，另因整年度水庫6~9月為空庫防淤期，水位低，更易於低沉積物易受擾動揚起造成透明度偏低，以致優養程度較為嚴重。 3.5藻類分析：灌溉口藻類計數1,850~3,980間，以矽藻為優勢種其次為綠藻，營養狀態屬中優養與優養。 3.6藻毒分析：所有測值皆符合WHO安全限值1.0 ug/L。 3.7臭味分析：測值皆能符合日本所定之標準(2-MIB 20ng/L、Geosmin 10ng/L)。 3.8農藥分析：所有測值低於偵測極限。 3.9魚類調查： 主要魚種有苦槽仔、武昌魚、三星鬪魚、紅鰭鮊、翹嘴紅鮊、雜交種吳郭魚及筍殼魚。生物多樣性分析結果與曾文水庫相似，優勢種不明顯，魚類物種分布尚屬平均。從豐富度指數值可看出阿公店水庫生物魚類種類多。 四、高屏溪攔河堰 4.1單項水質分析 101年1~12月高屏溪攔河堰超過水質標準之項目有懸浮固體、氨氮、生化需氧量、錳、總磷、大腸桿菌等6項。 生化需氧量、氨氮、大腸桿菌與總磷超過標準顯示有一般生活污水流入高屏溪中，目前此地區污水下水道普及率低，相關水質變化需長期持續觀察。高屏溪攔河堰地形屬淤積區段，以致於懸浮固體物數值偏高，相對造成水質中錳濃度之升高(水質中重金屬是以總量管制)。 4.2水體品質指標WQI：31~81間屬中下至良好，多屬中等等級。(中下1/36、中等21/36、良好14/36) 4.3河川污染指標RPI：1 ~3.75間屬未受污染至中度污染等級，大多屬中度污染等級。(中度污染32/36、輕度污染2/36、未受污染1/36) 河川污染指標達中度污染的原因，皆為懸浮固體物濃度超過100 mg/L所致(單項污染積分10分)。 4.4藻類分析：灌溉口藻類計數40~1,320間，以藍綠藻為優勢種其次為綠藻，營養狀態屬過優養。 4.5藻毒分析：所有測值皆符合WHO安全限值1.0 ug/L。 4.6臭味分析：2-MIB與Geosmin測值符合日本標準10 ng/L。 4.7農藥分析：所有測值低於偵測極限。 五、甲仙攔河堰 5.1單項水質分析 101年1~12月甲仙攔河堰超過水質標準之項目有pH、懸浮固體、錳、總磷、大腸桿菌等5項。 甲仙攔河堰根據以往監測的水質資料，在枯水期末期的降雨及颱風的暴雨影響，容易將土壤污染物沖刷至河川，會使得水質指標（懸浮固體、總磷與錳）變差。 甲仙攔河堰適用於甲類水體基準值（50CFU/100mL），本年度1-12月大腸桿菌群數值為5-220 CFU/100mL，因此1-12月合格率偏低。若以其他四水域乙類大腸桿菌群標準為5,000CFU/100mL，合格率則為100%。以乙類基準比較則所有甲仙攔河堰監測點皆符合規定。 5.2水體品質指標WQI：66~88間屬中等至特優，屬特優等級。(中等8/36、良好15/36、特優13/36) 5.3河川污染指標RPI：1~3.25屬未受污染至中度污染等級。(中度污染15/36、輕度污染2/36、未受污染16/36) 甲仙攔河堰WQI與RPI值於上半年皆屬特優及未受污染等級。並根據以往監測的水質資料，在枯水期末期的降雨及颱風的暴雨影響，容易將土壤污染物沖刷至河川，會使得水質指標（懸浮固體、總磷與錳）變差。且因較大降雨量使河川流量突增並造成懸浮固體物測值驟增(懸浮固體物濃度超過100 mg/L，單項污染積分10分)以致河川污染指標達中度污染。 5.4藻類分析：隧道入口藻類計數0~80間，藻類少屬貧養水質佳。 5.5藻毒分析：所有測值皆符合WHO安全限值1.0 ug/L。 5.6臭味分析：2-MIB與Geosmin測值符合日本標準10 ng/L。 5.7農藥分析：所有測值低於偵測極限。