臺灣早期之河川發展與管理工作較偏重於治水、利水的水利設施，較少考量整體的生態環境，近年來生態保育觀念提升，民眾對環境景觀的營造與環境保護的需求增加，因此本局於93~94年度辦理「淡水河系河川情勢調查計畫」，調查期間適逢「基隆河整體治理計畫(前期計畫)」執行相關治理工程，因此該計畫分別針對基隆河上中下游河段辦理生態調查之工作，並做為施工參考的依據；衡酌基隆河整體治理計畫(前期計畫)已完工多年，且河川生態資料為滿足水利工程單位進行生態環境保護之規劃、設計，亟需持續長期調查，以提供本局水利設施及河川環境改善之評估與參考，因此現階段有必要針對治理完成後之現況再進行調查，並分析治理前後狀況，檢討治理工程對現地環境之影響及改善成效，並針對治理後，對生態影響較大之河段，提出補強策略與建議。 「基隆河整體治理計畫(前期計畫)」於91年5月奉行政院核定同意辦理，計畫自91年7月起至94年止，分3年實施；所須經費新臺幣316億餘元並經立法院於91年7月同意以特別預算支應。治理計畫完成迄今已逾6年，期間經歷柯羅莎、卡玫基、辛樂克、薔蜜、芭瑪及梅姬等颱風侵襲，昔日所完成之治理工程是否有達到預期之設計目標，係為本計畫最主要之執行目的。 本計畫為兩年度計畫，第一年針對基隆河治理完成後之現況進行河川情勢調查，並分析治理前後環境之變化情形，以檢討治理工程對現地環境之影響及改善成效，檢討基隆河流域現況發展所面臨的課題及評估環境變遷影響性。第二年整合兩年調查結果，分別針對主流段現場情勢調查、河岸護破工程之抗沖蝕行為能力、水利工程及生態結合應用、水污染監測削減與環境生態營造評估、植生適性與生態效益及魚類生態指標與河川治理工程生態效益等做整體性評估，針對各河段之安全性、景觀性、親水性及環境生態復育性進行更深入的交叉其相互之影響。此外，針對未達預期目標的部份提出改善策略，據以擬訂流域整體治理及因應方案，以期建立整體規劃與聯合治理方針，降低流域水土災害風險並提升其生態環境改善成效。本計畫規劃監測及調查基隆河治理後河川環境之改善成效，針對改善成效顯著之治理方法進行研析，以做為後續其它河段治理之參考準則；對於改善成效不彰之治理方法，評估其原因並提出後續的補強策略。