本局依據行政院環境保護署所訂定相關監測規定及項目進行本特定區之水質監測,長期而持續之監測對於本特定區相關管理作業甚為重要,本計畫除執行本特定區內主支流河段河川水水質監測外,亦將所得之分析結果綜合研判本特定區污染來源及水質異常原因並探討可能影響層面,據此以採取適切之防治措施。此外,本計畫之水質監測成果按月提送行政院環境保護署參考及提供相關學術單位研究所需。