士文水庫集水區之年產砂量推估約為40萬噸/年,近年因應異常降雨已對台灣各流域產生影響,以民國98年莫拉克風災對南部各流域造成土砂量突增為最劇,士文溪亦於莫拉克風災之際形成形成士文溪堰塞湖,林務局對於該堰塞湖已於民國101年解除災害監測,爰此士文水庫規劃工作須先針對強降雨、再次形成堰塞湖情境及後續因應對策,由全流域土砂收支平衡觀點著眼,規劃管理方針,以謀求水庫永續經營、流域土砂合理應用。