本套書包含下列：

佛教邏輯通論（法藏知津‧二編‧第1冊）
漢譯《阿含經》之「厭離」研究（法藏知津‧二編‧第2冊）
道生頓悟說之理論基礎與義理內容（法藏知津‧二編‧第3冊）
曇鸞大師由仙轉佛之學思歷程研究（法藏知津‧二編‧第4冊）
魏晉佛學格義問題之考察──以道安為中心的研究（法藏知津‧二編‧第5冊）
《大乘起信論》如來藏緣起思想之探討（法藏知津‧二編‧第5冊）
智者大師的實相論與性具思想之研究（法藏知津‧二編‧第6冊）
天台圓教之淨土義與人間淨土之修證實踐（法藏知津‧二編‧第6冊）
天臺宗性具圓教之義理根據及其開展之獨特模式（法藏知津‧二編‧第7冊）
智顗佛性論研究（上）（法藏知津‧二編‧第8冊）
智顗佛性論研究（下）（法藏知津‧二編‧第9冊）
天台圓教十乘觀法之研究（法藏知津‧二編‧第10冊）
法藏圓融之「理」研究（法藏知津‧二編‧第11冊）
《六祖壇經》的生死哲學及其養生觀（法藏知津‧二編‧第12冊）
禪宗非語言行為之語言研究（上）（法藏知津‧二編‧第13冊）
禪宗非語言行為之語言研究（下）（法藏知津‧二編‧第14冊）
北宋契嵩的儒釋融會思想（法藏知津‧二編‧第15冊）
惠洪、張商英《妙法蓮華經合論》研究（法藏知津‧二編‧第16冊）
圓悟克勤禪學思想研究（法藏知津‧二編‧第17冊）
宋初智圓與契嵩對儒學的回應（法藏知津‧二編‧第17冊）
《楞嚴經正脈疏》「十番顯見」之研究──兼論與《楞嚴經會解》的比較（上）（法藏知津‧二編‧第18冊）
《楞嚴經正脈疏》「十番顯見」之研究──兼論與《楞嚴經會解》的比較（下）（法藏知津‧二編‧第19冊）
憨山自性禪思想之理論基礎與核心論題（上）（法藏知津‧二編‧第20冊）
憨山自性禪思想之理論基礎與核心論題（下）（法藏知津‧二編‧第21冊）
《四書蕅益解》研究（法藏知津‧二編‧第22冊）
參禪與念佛──晚明袁宏道的佛教思想（法藏知津‧二編‧第22冊）
方以智三教會通思想研究（法藏知津‧二編‧第23冊）
儒骨佛心──馬浮儒佛會通思想研究（法藏知津‧二編‧第24冊）