居住在海洋裡的龜爺爺是海洋裡最受大家尊敬的海洋守衛者，龜爺爺深知海龜家族保護海洋生態環境的使命，於是每天都帶著自己的孫子龜萌萌清理從附近大陸飄向海洋裡的各種生活固體廢棄物。忽然有一天，他們受到海洋垃圾形成的一種包圍圈「黑暗魔窟部落」的襲擊，「黑暗魔窟部落」吞噬的垃圾越多，其勢力就越強大，它將會變成海洋的終結者。龜爺爺和龜萌萌成了他們擴充疆土的絆腳石，幕後操控者「魔王」絕不允許任何生物破壞他的吞噬計劃，於是他指使手下「茶女巫」追殺龜爺爺與龜萌萌。茶女巫將龜爺爺弄進了無法逃離的魔網，龜萌萌臨危受命去尋求陳教授的幫助。紅麗、小哲和萌地球在海邊玩耍，救下了僥倖逃離受傷昏迷的龜萌萌，他們將龜萌萌送到了陳教授那裡進行救護，醒來的龜萌萌意外地見到陳教授並講述了祖孫倆的經歷。紅麗等人帶著龜萌萌乘坐陳教授研製的海洋清潔潛艇駛入了海面裡，踏上了拯救龜爺爺並消除海洋生態危機的征程……
