藉由審神者之力而得以顯現的付喪神‧刀劍男士們,回溯至過去的時代,為打倒妄想改變歷史的時間溯行軍而揮舞自身的刀刃。時間溯行軍依舊暗中出手,打算干預與坂本龍馬相關的歷史。在陸奧守不再執迷於前主人龍馬的同時,遇見土方歲三的堀川卻消失在眾人面前。當堀川再次站在和泉守面前時,竟然…!