本書是以《明清史料》、《明清檔案》、《中央研究院歷史語言研究所藏內閣大庫有關臺灣檔案目錄》為基礎,重新整理並加進一千九百多件新近完成提要的臺灣相關檔案,總計收錄5275件。本書包含三部份,即目錄、索引、DVD光碟片。目錄以及特別編製的主題分類索引,是以紙本方式出版,方便讀者查檢利用;DVD光碟片則燒錄了檔案影像與檢索系統,讓讀者可以在電腦上檢索、瀏覽、列印。