在一場大地震後台灣靈異現象激增，警方為此成立了「黑日專案」，一個以處理靈異事件為主的專案隊。 隊員之一的主角「陳柏戎」在一次除妖行動中，遇見了與媽祖相同名諱的小女孩「林默娘」。 兩人結伴對抗不斷出現的新襲擊，就此展開了現代媽祖冒險譚
