《五世達賴喇嘛傳》的第二函，計分上、下兩冊共十九節，記述了五世達賴喇嘛從1666年到1676年的十年間的事跡。這期間對五世達賴喇嘛從1666年到1676年的十年間的事跡。這期間對五世達賴喇嘛來說，是他鞏固和發展自己的政治和宗教權威的重要時期。在他和固始汗1653年取得清朝皇帝的冊封之後不久，固始汗和四世班禪繼去世，西藏的政治和宗教領袖，唯五世達賴喇嘛碩果僅存，為各方希望所繫，他透過掌握第巴的任命權和影響力以及碩特部汗王的繼承，逐步集中了西藏的政教權力，成為西藏至高無上的政教領袖。
本第二函書中，並詳細記載了第巴的任命和就職，以及碩特汗王的繼位和慶典等，反映了西藏當時平靜的權力轉移過程。而這些歷史的演進，在清朝的檔案和其他的史籍中都沒有記載，更加凸現出《五世達賴喇嘛傳》史料的珍貴價值。本書上、下冊的內容，還涉及當時新興的甘丹頗章政權，維修寺院、發展文化、吸納各個地方的僧俗勢力，參與西藏的政教管理等重要內容。
正是這一時期，五世達賴喇嘛的政教活動，為以後的曆世達賴喇嘛的地位，奠定了難以動搖的根基，所以被後人稱為「阿巴欽波」，即「偉大的五世」。因此，對研究西藏此一時期的重要歷史和歷代達賴喇嘛歷史的人而言，乃至對於格魯派的信徒來說，本冊的內容都是不可不讀的史料。
本第二函書中，並詳細記載了第巴的任命和就職，以及碩特汗王的繼位和慶典等，反映了西藏當時平靜的權力轉移過程。而這些歷史的演進，在清朝的檔案和其他的史籍中都沒有記載，更加凸現出《五世達賴喇嘛傳》史料的珍貴價值。本書上、下冊的內容，還涉及當時新興的甘丹頗章政權，維修寺院、發展文化、吸納各個地方的僧俗勢力，參與西藏的政教管理等重要內容。
正是這一時期，五世達賴喇嘛的政教活動，為以後的曆世達賴喇嘛的地位，奠定了難以動搖的根基，所以被後人稱為「阿巴欽波」，即「偉大的五世」。因此，對研究西藏此一時期的重要歷史和歷代達賴喇嘛歷史的人而言，乃至對於格魯派的信徒來說，本冊的內容都是不可不讀的史料。